Большое количество последовательностей (в том числе полных последовательностей геномов), которые уже установлены и продолжают накапливаться , создает проблему их хранения и анализа. Понятно, что такой вопрос, который встает уже при сравнении последовательностей отдельных клонированных фрагментов с целью выяснения нуклеотидной последовательности генома, может быть решена только с помощью компьютеров. Биоинформатика? отрасль, связанная с решением подобных проблем, сегодня неотъемлемой частью молекулярной биологии. Самые общедоступные через Интернет базы данных нуклеотидных и аминокислотных последовательностей создан в Европейской лаборатории.

Молекулярной Биологии (EMBL Sequence Data Base) и Национальный институт здоровья США (GenBank). На соответствующих порталах размещен также программные средства сравнения последовательностей, поиска промоторов, стартовых точек транскрипции, интронов и экзонов, определения белковых последовательностей из последовательностей нуклеотидов и т.п.. Среди баз данных on-line следует упомянуть также базы данных пространственных структур белков (Protein Data Bank) и нуклеиновых кислот (Nucleic Acid Database).

На основе биоинформатичного анализа можно установить, например, функциональное значение неизвестного только клонированного гена с его гомологией с известным геном другого организма, структуру гена (найти промотор, экзонов, точки терминации транскрипции), структурнофункциональни особенности новых белков, функциональные связи между различными белками и генами, филогенетические отношения между различными таксонами. Благодаря развитию биоинформатики существует возможность (в дополнение к результатам, которые получают in vivo и in vitro) решать различные проблемы просто с помощью компьютера in silico.


Загрузка...
Яндекс.Метрика Google+