Более радикальным и эффективным путем устранения нарушений нуклеотидов является эксцизионной репарации , когда повреждена одноцепная участок вырезается из ДНК, а другая цепь используется далее как матрица для нового синтеза. Существует два варианта такой репарации.

При ексицизийний репарации азотистых оснований (Base Excision Repair BER), что происходит у всех организмов, модифицированная азотистое основание распознается ферментом, который отщепляет ее от дезоксирибозы (рис. 1.21). В ДНК остается так называемый АП-сайт? апуриновий / апиримидиновий. Еще два ферменты удаляют дезоксирибозу в АП-сайте, и в ДНК остается пробел длиной в один нуклеотид.

Этот пробел восполняется ДНК-полимеразой ? (в эукариот), которая присоединяет нуклеотид к 3'-ОН группы предыдущего нуклеотида цепи. Фосфодиэфирных связь присоединенного нуклеотида с последующим нуклеотидом цепи восстанавливается лигазы. У прокариот заполнение пробела осуществляется ДНК-полимеразой И.

Эксцизионной репарации нуклеотидов (Nucleotide Excision Repair? NER) это путь, связанный с вырезанием одноцепочечной участки ДНК, которая содержит повреждения (модифицированную основу, тиминовых димер т.д.). В клетках E. coli за этот путь соответствует а система uvrABC (uvr? ultra violet repair). Комплекс белка uvrB и двух белков uvrA узнает повреждения и связывается с ДНК в этом месте (рис. 1.22). На следующем шаге происходит изменение конформации uvrB, изгиб ДНК и диссоциация uvrA. К комплексу рекрутируется белок uvrС. Оба белки в составе комплекса приобретают ендонуклеазнои активности: uvrС делает одноцепочечный разрез в поврежденном цепи за несколько нуклеотидов в направлении 5'-конца от повреждения (слева на рис. 1.22); uvrB? разрез с другой стороны от повреждения. Далее ДНК-геликаза uvrD разрушает двойную спираль между двумя разрезами, то есть удаляет поврежденный участок. Пробел, оставшуюся заполняется ДНК-полимеразой и, лигаза окончательно восстанавливает целостность цепи. Аналогичная система эксцизионной репарации, к которой привлечены около 17 белков, работает в эукариотических клетках.


Загрузка...
Яндекс.Метрика Google+