ДНК в живых системах постоянно взаимодействует с большим количеством белков. На поверхности ДНК расположены фосфатные остатки и екзоцикличные группы азотистых оснований в желобкам. Именно эти группы и привлекаются к контактам с аминокислотными боковыми остатками и пептидными группами на поверхности белка. Все белки, которые взаимодействуют с ДНК, можно разделить на две категории: те, которые связываются с ДНК любой последовательности, и те, которые осуществляют специфическое опознания определенной последовательности пар оснований. Белки, осуществляющие такое опознание, как правило, взаимодействуют и с другой последовательностью ДНК неспецифически.

Несколько примеров структуры белково-нуклеиновых комплексов приведены на рис. 1.7. Дымер гистонов Н3-Н4 (рис. 1.7, а) осуществляет неспецифические электростатические (ионные) взаимодействия с фосфатами ДНК, выполняя роль в упаковке ДНК в клеточном ядре, о чем речь пойдет ниже. Другие белки, изображенные на рис. 1.7, выполняют роль регуляторов генной активности, специфически узнавая определенные участки последовательности. Главным условием реализации контактов между ДНК и белком является взаимная подгонка структуры взаимодействующих элементов вследствие соответствующих конформационных превращений: путем определенных структурных перестроек (иногда небольших, иногда довольно значительных) двойной спирали химические группы ДНК "подводятся" под контакты с белковыми химическими группами. То есть для эффективного опознания необходима определенная конформация двойной спирали и / или определенные изменения этой конформации. И то, и другое определяется последовательностью пар оснований.


Загрузка...
Яндекс.Метрика Google+