HMGN - неупорядоченный полипептид длиной ~ 100 аминокислот, который существует в двух вариантах: HMGN-1, 2 (старое название HMG-14, 17). Содержание HMGN в хроматине варьирует для разных тканей, но не превышает одной копии на нуклеосому. В цепи есть две зоны (домены): положительно заряженный NBD (Nucleosome Binding Domain) - участок от - 10-й до 40-й аминокислоты, взаимодействует с нуклеосомы; и отрицательно заряженный С-концевой CUD (Chromatin Unfolding Domain). NBD взаимодействует с двумя соседними витками нуклеосомнои суперспираль ДНК, и это взаимодействие стабилизирует структуру нуклеосомы. С одной нуклеосомы кооперативно (повышая родство друг друга) связываются две молекулы HMGN, причем всегда одного типа (1 или 2). С-конечная отрицательно заряженная часть молекулы конкурирует с ДНК за гистонов хвосты. В результате HMGN, который накапливается в транскрипционно активных участках, способствует деконденсация хроматиновыми фибриллы. Взаимодействие HMGN с нуклеосомы - слабая, то есть он, как и HMGВ, лишь на короткое время (среднее время иммобилизации -30 С) повышает доступность ДНК для других элементов системы активации транскрипции. На некоторых нуклеосомы (в зависимости от компактности фибриллы, контекста модификаций, кофакторов) HMGN может задерживаться на более долгое время и тогда стимулировать транскрипцию.


Загрузка...
Яндекс.Метрика Google+